Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer

Günlük ölçekleme ile jeller (agaroz ve PAGE) bantları analiz için 1 android uygulaması

* Android OS değişikliklerine uygun olarak, lütfen sürücü / SD kartlarını köklendirecek ES Dosya Gezgini'ni kullanarak yerel dosyalara erişin. İlk önce köklendirme yapmak için ES Dosya Gezgini'ne girmeniz gerekecektir. Android ve Dropbox'taki değişiklikler nedeniyle Dropbox desteğinin kaldırıldığını lütfen unutmayın.

Bu, jellerden (hem agaroz hem de PAGE) bantları otomatik olarak işaretleyicilerin oluşturduğu bir günlük grafiğiyle analiz etmenizi sağlayan ilk android uygulamasıdır. Gelecek kullanımlar için otomatik tespit ve yükleme sağlar. Gabor filtresi kullanarak, bu uygulama kullanıcıların bantların otomatik olarak algılanmasını geliştirmelerine olanak tanır. Düşük kaliteli görüntüler için, kullanıcılar istenilen bant üzerinde bir kutu çizebilir veya belirtilen konumu belirlemek için görüntü üzerine tıklayabilirler.

Görüntüler galeri veya dropbox'tan yüklenebilir, bu da çok kullanışlı hale gelir. En iyi görüntüler tarayıcılar tarafından oluşturulanlardır, ancak mobil kameralardan iyi çekilmiş fotoğraflar ile çalışır.

Fotoğraflar jel ile doğrudan düzlemde alınmalıdır.

Bu uygulamanın özellikleri şunları içerir:

1) Agaroz veya SAYFA'nın belirtilmesi.

2) PAGE için işaretleyici bantların renk tanımlaması.

3) Gelişmiş görüntüleme filtreleri - Garbor.

4) Gerekirse özelleştirilmiş kullanıcı girişi ile otomatik görüntü işleme.

5) Gelecekte kolaylık sağlamak için görüntü işleme için ayarların kaydedilmesi.

6) Aynı markörleri kullanırken gelecekteki kolaylık için işaretleyicilerin kaydedilmesi.

7) Basit ve düğmeli kullanıcı arayüzü.

8) Bantların otomatik tespiti.

9) Basit kullanıcı tanımlı sınır kutusu.

10) Otomatik olarak oluşturulan işaretçinin log grafiği.

11) Belirli bantların kullanıcı tarafından tanımlanan yeri.

12) Çok boyutlu tabletlerin ve akıllı telefonların yatay ve dikey görünümü ile uyumluluk.

13) İncelenen jel ve log grafik akıllı telefonların ekran görüntüleri ve yayınlar veya raporlar için tabletlerle uyumluluk.

14) Vurgulanan kutular ve hesaplanan bant büyüklüğü ile jel görüntüsünde görüntülenen okumalar.

15) Analizden önce görüntüler için kırpma fonksiyonu.

16) İstenmeyen bantları kaldırmak için işlevi düzenleyin.

17) İşaretleyiciler ve bantlar için farklı renkli kutular.

18) Resimler için Resim galerisine basit doğrudan erişim.

19) Sybr Green, EtBr agaroz jel analizi ile uyumludur.

20) Doğrudan kamera erişimi.

Bu uygulamayı yayınlar için kullanmanın yararları

1) Yaklaşımlara dayanmak yerine jel analizinize daha fazla doğruluk getirir.

2) Değer, yayınlara ve raporlara ekler.

3) Fen öğrencilerine faydalı öğretim aracı.

4) Analitik analiz, insan hatalarını ve öznelliği azaltır - artık kursiyerler ve daha az deneyimli personel tarafından bildirilen değerlere güvenebilirsiniz!

5) akıllı telefon / tablet ile halindeyken analiz.

6) Otomatik analiz - grafik kağıdı ve sıkıcı komplo için gerek yok.

7) uygulama ücretsizdir!

8) Uygulama kendi kendine yeten, hiçbir internet erişimi (dropbox analizi için sürece) gerekli değildir.

Android 6 kullanıcıları yerel "Resim" galerisinden resimler alabilir. Daha eski Android sürümü kullanıcıları DropBox'ı destekleyecek. Bu, Android 6'daki değişikliklerden kaynaklanmaktadır ve bizim kontrolümüzün ötesindedir.

Kullanmak için lütfen https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be adresinden video izleyin.

Userguide, http://tinyurl.com/GelApp adresinde pdf olarak bulunur

* Son telefonlar Samsung Note 8 kamera tasarrufu ile ilgili sorun yaşayabilir. Böyle bir sorun varsa galeriyi kullanın.

Alıntı yapmak için lütfen kullanın:

Sim, JZ. *, Nguyen, PV. *, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: Mobil jel elektroforezi analizörü. Doğa Yöntemleri Uygulama Notları. doi: 10.1038 / an9643

VEYA doğrudan App Store'daki yazılıma

Sim, J.Z., Nguyen, P.V., Gan, S.K.E. (2014) GelApp: DNA ve Prot Jel Analyzer v1.2. [Mobil Uygulama Yazılımı]. Https://play.google.com adresinden alındı

Bu uygulama, Antikor ve Ürün Geliştirme Laboratuvarı, Translasyonal Araştırma Bölümü, Biyoenformatik Enstitüsü, Bilim, Teknoloji ve Araştırma Ajansı, Singapur ürünüdür.

Yaratıcılar şunlardır: Bay Jia Zhi, Bay NGUYEN Phi Vu ve Dr. Samuel GAN.

                    (Poly intern) (Araştırma Görevlisi) (Müdür Asistanı)